GROMACS形式のTopologyファイルのAMBER形式への変換

投稿日: 投稿者:

環境: macOS Sierra 10.12.1, Gromacs 2016.1, AmberTools 16.
参照: ParmEd 2.5.0 documentation » Using parmed

$ parmed
> gromber topol.top
> outparm amber.prmtop
> quit

座標ファイルも変換したい場合は，

$ parmed
> gromber topol.top conf.gro
> outparm amber.prmtop amber.inpcrd
> quit

(了)

コメントを残す

メールアドレスが公開されることはありません。 ※ が付いている欄は必須項目です

CAPTCHA


このサイトはスパムを低減するために Akismet を使っています。コメントデータの処理方法の詳細はこちらをご覧ください。