非拮抗阻害ではIC50 = Ki

先日の文献セミナーで酵素阻害剤の阻害様式についてよく分かっていなくて、IC50Kiの関係について頓珍漢な質問をしてしまったのでメモ。

最初にまとめを引用します:

IC50Ki値の関係は、in vitroの試験では [S] >> Kmが成立するので、非拮抗阻害や不拮抗阻害ではIC50 = Kiであり、拮抗阻害ではKi = IC50/(1 + [S]/Km) からKi値が換算される(Km: ミカエリス定数、Ki: 阻害定数)
安達ら、2010

解説

解説と画像はBuker, S. M., et al., Enzyme–Inhibitor Interactions and a Simple, Rapid Method for Determining Inhibition Modality. SLAS Discovery 2019, 24, 515–522からです。

  • (純粋な)拮抗阻害(competitive inhibition; 競合阻害、競争阻害)では、阻害剤 I は E にのみ結合する。
  • (純粋な)非拮抗阻害(non-competitive inhibition; 非競合阻害、非競争阻害)では、阻害剤 I は E にも ES にも同じ親和性で結合する。
  • (純粋な)不拮抗阻害(uncompetitive inhibition; 不競合阻害、不競争阻害)では、阻害剤 I は ES にのみ結合する。
Figure 1 from Buker, S. M., et al., 2019. (CC BY-NC-ND 4.0)

50%阻害濃度IC50と阻害定数Kiの関係は以下の式で表わされます。

$$ {\mathrm{IC}}_{50} = \frac{[S] + K_{\mathrm m}}{\frac{K_{\mathrm m}}{K_{\mathrm i}} + \frac{[S]}{\alpha K_{\mathrm i}}} $$ この式は混合型阻害(mixed-type inhibition)に対するCheng–Prusoff式(Cheng and Prusoff, 1973)と同一。阻害様式の解析のために、IC50を [S]/Kmに対してプロットしたいので、上の式を変形すると以下のようになります。 $$ {\mathrm{IC}}_{50} = \frac{1 + \frac{[S]}{K_{\mathrm m}}}{\frac{1}{K_{\mathrm i}} + \left(\frac{1}{\alpha K_{\mathrm i}} \times \frac{[S]}{K_{\mathrm m}}\right)} $$

  • \( \alpha \) が \( \infty\) に近付く(=(純粋な)拮抗阻害) と、$$ {\mathrm{IC}}_{50} = \frac{1 + \frac{[S]}{K_{\mathrm m}}}{\frac{1}{K_{\mathrm i}}} = K_{\mathrm i} \left(1 + \frac{[S]}{K_{\mathrm m}}\right)$$
  • \( \alpha = 1 \) (=(純粋な)非拮抗阻害)の時、 $$ {\mathrm{IC}}_{50} = K_{\mathrm i}$$
  • \( K_{\mathrm i} \) が \( \infty\) に近付くが、\( \alpha K_{\mathrm i}\) が有限(=(純粋な)不拮抗阻害)の時、$$ {\mathrm{IC}}_{50} = \alpha K_{\mathrm i} \left(1 + \frac{K_{\mathrm m}}{[S]}\right)$$

それぞれの場合(+ 混合型阻害の場合)で、IC50を [S]/Kmに対してプロットすると以下のようになります。

Figure 5 from Buker, S. M., et al., 2019. (CC BY-NC-ND 4.0)

コメントを残す

メールアドレスが公開されることはありません。 が付いている欄は必須項目です

CAPTCHA


このサイトはスパムを低減するために Akismet を使っています。コメントデータの処理方法の詳細はこちらをご覧ください