Conformational Search of Small Molecules Using GROMACS
GROMACSのSimulated annealing me …
Gromacs 2025.2のCentOS 7へのインストールメモ。
$ wget https://ftp.gromacs.org …
AlphaFold2
AlphaFold2 Alphabet Inc. 傘下のDe …
Conformations of 2-Cyclohepten-1-one (Tropilene)
メモ. Programs: Gromacs (2020) …
タンパク質-リガンド複合体の脂質二重膜への挿入
研究室内メモ 環境: CentOS 7, GROMACS 2 …
RDKitを使った低分子のコンホメーション探索
RDKitによる低分子のコンホメーション探索¶ …
Windows用プログラムの動作確認
Windows用の導入と動作確認 環境: CentOS 7. …
PLUMED-patched GROMACSのインストールとテスト
研究室内メモ 環境: CentOS 7. GROMACS 2 …
ワークステーション導入の記録、Feb. 6–17, 2020。
“Great Red Oystrich Make …
QBMG (quasi-biogenic molecule generator) (Zheng et al., 2019) を試す
研究室内メモ． 論文紹介． 環境: macOS Sierra …