ワークステーションのOS更新（CentOS 7 → AlmaLinux 8）
研究室のワークステーションのOSを、サポートが2024年6月 …
CREST（Conformer–Rotamer Ensemble Sampling Tool）による配座探索
CRESTはGrimmeグループによって開発された配座探索ツ …
Conformational Search of Small Molecules Using GROMACS
GROMACSのSimulated annealing me …
Gromacs 2025.2のCentOS 7へのインストールメモ。
GROMACS 2025.2のCentOS 7（CUDA 1 …
AlphaFold2
AlphaFold2 Alphabet Inc. 傘下のDe …
Conformations of 2-Cyclohepten-1-one (Tropilene)
メモ. Programs: Gromacs (2020) …
タンパク質-リガンド複合体の脂質二重膜への挿入
研究室内メモ 環境: CentOS 7, GROMACS 2 …
RDKitを使った低分子のコンホメーション探索
RDKitによる低分子のコンホメーション探索 …
Windows用プログラムの動作確認
Windows用の導入と動作確認 環境: CentOS 7. …
PLUMED-patched GROMACSのインストールとテスト
研究室内メモ 環境: CentOS 7. GROMACS 2 …